pdf fájlokból oldalanként jpg:

gs -dNOPAUSE -dBATCH -sDEVICE=jpeg -dJPEGQ=95 -dQFactor=5.0 -sOutputFile=image-%03d.jpg -r600x600 -f valami.pdf

jpg fájloból pdf

convert *.jpg +compress egyben.pdf

Kapásból nem biztos, hogy menni fog. Ha nem, akkor /etc/ImageMagick-6/policy.xml -be megváltoztatni:
<policy domain="coder" rights="read|write" pattern="PDF" />